雙鏈核糖核酸病毒
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The dsRNA Viruses
混合病毒科(Amalgaviridae)
雙核糖核酸病毒科（Birnaviridae）
金色病毒科（Chrysoviridae）
金色病毒屬（Chrysovirus）
囊狀噬菌體科（Cystoviridae）
内源核糖核酸病毒科（Endornaviridae）
巨大双分核糖核酸病毒科（Megabirnaviridae）
分體病毒科（Partitiviridae）:双分病毒科
小双节病毒科(Picobirnaviridae)
Quadriviridae
呼腸孤病毒科（Reoviridae）
光滑呼腸孤病毒亚科（Sedoreovirinae）
轮状病毒属（Rotavirus）
刺突呼腸孤病毒亚科（Spinareovirinae）
整體病毒科（Totiviridae）:全病毒科
正鏈核糖核酸病毒
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主条目：正义单链RNA病毒
網巢病毒目（Nidovirales）：成套（套式）病毒目
动脉炎病毒科（Arteriviridae）
冠狀病毒科（Coronaviridae）
海洋病毒科（Mesoniviridae）
桿狀套病毒科（Roniviridae）
小核糖核酸目（Picornavirales）
二順反子病毒科（Dicistroviridae）
传染性软化病毒科（Iflaviridae）
海洋RNA病毒科（Marnaviridae）
微小核糖核酸病毒科（Picornaviridae）：小核糖核酸病毒科
伴生豇豆病毒科(Secoviridae)
豇豆鑲嵌病毒亚科（Comoviridae）
Bacillarnavirus
Labyrnavirus
芜菁黄花叶病毒目(Tymovirales)
甲型线形病毒科（Alphaflexiviridae）
乙型线形病毒科(Betaflexiviridae)
丙型线形病毒科(Gammaflexiviridae)
蕪菁發黃鑲嵌病毒科（Tymoviridae）
（以下未设目）
Alphatetraviridae
Alvernaviridae
星狀病毒科（Astroviridae）
桿菌狀核糖核酸病毒科（Barnaviridae）
甜菜壞死黃脈病毒科Benyviridae
甜菜壞死黃脈病毒屬（Benyvirus）-代表種：甜菜壞死葉脈變黃病毒（Beet necrotic yellow vein virus）
雀麥花葉病毒科（Bromoviridae）
杯狀病毒科（Caliciviridae）：嵌杯病毒科
Carmotetraviridae
修道院病毒科（Closteroviridae）
黃病毒科（Flaviviridae）
肝炎病毒科（Hepeviridae）
低毒性病毒科（Hypoviridae）：
低毒性病毒属（Hypovirus)
光滑病毒科（Leviviridae）：光滑噬菌體科
黃症病毒科（Luteoviridae）
裸露核糖核酸病毒(Narnaviridae)
野田病毒科('Nodaviridae')
Permutotetraviridae
馬鈴薯Y病毒科（Potyviridae）
披衣病毒科（Togaviridae）
番茄叢矮病毒科（Tombusviridae）
帚状病毒科(Virgaviridae): 植物杆状病毒科
菸草鑲嵌病毒屬（Tobamovirus）-代表種：菸草鑲嵌病毒（Tobacco mosaic virus）
菸草脆裂病毒屬（Tobravirus）-代表種：菸草脆裂病毒（Tobacco rattle virus）
大麥病毒屬（Hordeivirus）大麥蛋白病毒屬-代表種：大麥條紋鑲嵌病毒（Barley stripe mosaic virus）
真菌傳桿狀病毒屬（Furovirus）-代表種：土傳小麥鑲嵌病毒（Soil-borne wheat mosaic virus）
花生叢簇病毒屬（Pecluvirus）-代表種：花生矮叢矮病毒（Peanut clump virus）**馬鈴薯病毒屬（Pomovirus）馬鈴薯拖把（帚）狀頂部病毒屬-代表種：馬鈴薯拖把狀頂部病毒（Potato mop-top virus）
（以下未設科）
Cilevirus
Higrevirus
懸鈎子病毒屬（Idaeovirus）-代表種：覆盆子叢矮病毒（Raspberry bushy dwarf virus）（木莓；紅刺莓）
欧尔密病毒属(Ourmiavirus)
一品红潜隐病毒属(Polemovirus)
南方菜豆花葉病毒屬（Sobemovirus）-代表種：南方豆鑲嵌病毒（Southern bean mosaic virus）
反鏈核糖核酸病毒
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The negative-sense ssRNA Viruses
單股反鏈病毒目（Mononegavirales）
玻那病毒科（Bornaviridae）博爾納病毒科
玻納病毒屬（Bornavirus）
玻納疾病病毒（Borna disease virus）
纖維病毒科（Filoviridae）
Cuevavirus
伊波拉病毒屬（Ebolavirus）埃波拉病毒屬
薩伊伊波拉病毒(Zaire ebolavirus):伊波拉病毒
馬爾堡病毒屬（Marburgvirus）
維多利亞湖馬爾堡病毒（Lake Victoria marburgvirus）
Nyamiviridae
副黏液病毒科(Paramyxoviridae):麻疹病毒
副黏液病毒亞科（Paramyxovirinae）
肺炎病毒亞科（Pneumovirinae）肺病毒亞科
炮彈病毒科（Rhabdoviridae）杖竿狀病毒科
（以下未设目）
沙狀病毒科（Arenaviridae）砂粒狀病毒科
本雅病毒科（Bunyaviridae）布尼亞病毒科；崩芽病毒科
蛇形病毒科(Ophioviridae)
正黏液病毒科（Orthomyxoviridae）
（以下未設科）
Deltavirus
Emaravirus
Tenuivirus
葉脈曲張病毒屬（Varicosavirus）